ZNF304 gen ifadesinde artış ve CXCR4’de azalma ile prostat kanserinde anoikis değişebilir

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0003-2143-5268
dc.authorid0000-0002-6183-9489
dc.contributor.authorAyla, Şule
dc.contributor.authorÖktem, Gülperi
dc.contributor.authorParlayan, Cüneyd
dc.date.accessioned08.07.201910:49:13
dc.date.accessioned2019-07-08T20:18:33Z
dc.date.available08.07.201910:49:13
dc.date.available2019-07-08T20:18:33Z
dc.date.issued2018
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü
dc.description.abstractAmaç: Prostat kanser hücre hattı (DU145) ve prostat normal epitel hücre hatları (RWPE) arasında anoikis mekanizmasını arttıracak veya inhibe edebilecek genlerin analizini yapmak ve kanser gelişiminde olası rolünü incelemek. Gereç ve Yöntem: İnsan prostat epitel hücre hattı (RWPE) ve prostat kanseri hücre hatları (DU-145) Amerikan Tip Kültür Koleksiyonu (ATCC)’den temin edildi. Hücre hatlarının çoğaltılmasında ve sürdürülmesinde RPMI 1640 (Biological Industries) besi ortamı kullanıldı. Transkriptom analizi için RNA izolasyonu yapılarak, kütüphane oluşturuldu, kütüphanenin kantitasyonunun ardından NextSeq500 (illumina) ile sekanslama yapıldı. Dizileme, haritalandırma, bağıl gen ifadeleri ölçümleri gibi biyoinformatik analizler Genomics Workbench v 8 (Qiagen) yazılımı kullanılarak GRCh38 referans sekansı ile yapılmıştır. Bulgular: RWPE Normal prostat epitel hücre kültürleri ile DU145 prostat kanser hücreleri karşılaştırıldığı zaman DU-145 prostat kanser hücre kültürlerinde, ZNF304, PYCARD ve Notch3 gen expresyonlarında anlamlı bir artış (p<0,05) görülürken, CXCR4, Pak3, SerpınB1 gen ekspresyonlarında anlamlı bir azalma (p<0,05) görülmüştür. Sonuç: DU145 prostat kanseri hücre hattında anoikis ile ilişkili önemli gen ekpresyonlarında artış ve azalma gözlemledik. Değişime bağlı olarak hücrelerin anoikisden kaçarak metastatik özellik kazanabileceğini düşündük.
dc.description.abstractAim: To analyze genes that may increase or inhibit the anoikis mechanism between prostate cancer cell line and prostate normal epithelial cell line and examine the possible role of cancer in cancer development. Materials and Methods: Human prostate epithelial cell line (RWPE) and prostate cancer cell line (DU145) were acquired from ATCC. Both cell lines were maintanied in RPMI 1640 (Biological Industries) medium. Total RNA were isolated and fragmented. Adapters were ligated to prepare RNA library for whole trasncriptome experiments. Statistics and bioinformatics analysis including mapping, clustering, sequencing were done by using Genomics Workbench v 8. (Qiagen) software. Results: As we compared the normal prostate ephitalial cells (RWPE) and prosatate cancer cells (DU 145); ZNF304,PYCARD ve NOTCH3 were significantly (p<0.05) up-regulated in DU145 cells, on the other hand, CXCR4, PAK3, SERPINB1 genes were significantly down-regulated. Conclusion: We found that there are significant differential gene expressions in DU-145 cells which may lead to metastatic state via evasion of anoikis process.
dc.identifier.citationAyla, Ş., Öktem, G. ve Parlayan, C. (2018). ZNF304 gen ifadesinde artış ve CXCR4’de azalma ile prostat kanserinde anoikis değişebilir. Ege Tıp Dergisi, 57(3), 157-162.
dc.identifier.endpage162
dc.identifier.isbn9780128095973en_US
dc.identifier.isbn9780128149256en_US
dc.identifier.issn1016-9113
dc.identifier.issue3
dc.identifier.startpage157
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12511/361
dc.identifier.volume57
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.ispartofEge Tıp Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectKanser
dc.subjectCancer
dc.subjectApoptozis
dc.subjectAnoikis
dc.subjectMezenkimal Geçiş
dc.subjectApoptosis
dc.subjectAnoikis
dc.subjectMesenchymal Transition
dc.titleZNF304 gen ifadesinde artış ve CXCR4’de azalma ile prostat kanserinde anoikis değişebilir
dc.title.alternativeSignificant increase in ZNF304 and decrease in CXCR4 gene expressions may alter anoikis in prostate cancer
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
ayla-sule(2018).pdf
Boyut:
302.6 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Makale Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu