Detection of allele and genotype frequencies of bovine leukocyte adhesion deficiency, factor XI deficiency and complex vertebral malformation disease genes in holstein cattle

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-6183-5015
dc.contributor.authorHacıhasanoğlu Çakmak, Neziha
dc.contributor.authorYardibi, Hasret
dc.date.accessioned10.07.201910:49:13
dc.date.accessioned2019-07-10T19:49:45Z
dc.date.available10.07.201910:49:13
dc.date.available2019-07-10T19:49:45Z
dc.date.issued2019
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Tıbbi Laboratuvar Teknikleri Ana Bilim Dalı
dc.descriptionWOS: 000472627700013
dc.description.abstractHereditary diseases cause yield and economic loses. It is important to examine hereditary diseases at the molecular level and to remove diseases from the herd. In our study, it was aimed to determine allele frequencies of genes that cause bovine leukocyte adhesion deficiency, factor XI deficiency and complex vertebral malformation diseases in Holstein cattle. Blood samples were randomly taken from 300 Holstein cattle in different dairy farms in Kocaeli, Sakarya and Balikesir provinces. Deoxyribonucleic acid samples were isolated from blood samples by using the standard ammonium acetate salt-out method. The target regions were amplified by polymerase chain reaction to determine the mutant alleles causing bovine leukocyte adhesion deficiency, factor XI deficiency and complex vertebral malformation. According to the nucleotide chromotograms of the samples subjected to bovine leukocyte adhesion deficiency analysis, it was determined that 4 out of 300 cattle were heterozygous and 296 were homozygous. Polymerase chain reaction procedure for factor XI deficiency disease was sufficient, while samples amplified by polymerase chain reaction for complex vertebral malformation disease were subjected to restriction particle length polymorphism. Factor Xl deficiency and complex vertebral malformation disease genes were all homozygous normal.
dc.description.abstractKalıtsal hastalıklar verim ve ekonomik kayıplara neden olur. Kalıtsal hastalıkları moleküler düzeyde incelemek, Kalıtsal hastalıklar verim ve ekonomik kayıplara neden olur. Kalıtsal hastalıkları moleküler düzeyde incelemek, hastalıkları sürüden uzaklaştırmak için önemlidir. Araştırmamızda, Holstayn ırkı sığırlarda sığır lökosit bağlanma yetmezliği, faktör XI eksikliği ve kompleks vertebral malformasyon hastalıklarına sebep olan genlerin allel sıklıklarının tespit edilmesi amaçlanmıştır. Kocaeli, Sakarya ve Balıkesir illerinde bulunan farklı çiftliklerdeki 300 adet Holştayn sığırdan kan örnekleri alınmıştır. Kan örneklerinden standart amonyum asetat çöktürme yöntemiyle deoksiribonükleik asit örnekleri izole edilmiştir. Sığır lökosit bağlanma yetmezliği, faktör XI eksikliği ve kompleks vertebral malformasyona sebep olan mutant allelleri belirlemek için hedef bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmıştır. Sığır lökosit bağlanma yetmezliği için dizin analizi işlemine tabi tutulan örneklerin nükleotid kromotogramlarına göre toplamda 300 adet sığırdan 4 tanesi heterozigot birey, 296 tanesinin homozigot birey olduğu tespit edilmiştir. Faktör XI eksikliği hastalığı için polimeraz zincir reaksiyonu işlemi yeterli olup, kompleks vertebral malformasyon hastalığı için ise polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılan örnekler restriksiyon parçacık uzunluğu polimorfizmi işlemine tabi tutulmuştur. Faktör XI eksikliği ve kompleks vertebral malformasyon hastalıkları genlerinin hepsi homozigot normal bulunmuştur.
dc.description.sponsorshipIstanbul University BAP Project Application [38954]en_US
dc.description.sponsorshipThis study was supported by the Istanbul University BAP Project Application (Project number: 38954). This study was produced from a PhD thesis. We wish to thank the cattle Breeders of Kocaeli, Sakarya and Balikesir.en_US
dc.identifier.citationHacıhasanoğlu Çakmak, N. ve Yardibi, H. (2019). Detection of allele and genotype frequencies of bovine leukocyte adhesion deficiency, factor XI deficiency and complex vertebral malformation disease genes in holstein cattle. Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 66(3), 311-315. https://dx.doi.org/10.33988/auvfd.436199
dc.identifier.doi10.33988/auvfd.436199
dc.identifier.endpage315
dc.identifier.issn1300-0861
dc.identifier.issn1308-2817
dc.identifier.issue3
dc.identifier.scopusqualityQ3
dc.identifier.startpage311
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.33988/auvfd.436199
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12511/1750
dc.identifier.volume66
dc.identifier.wosqualityQ4
dc.indekslendigikaynakWeb of Science
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isoen
dc.publisherAnkara University Press
dc.relation.ispartofAnkara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectAnaemia
dc.subject?2 Integrin Glycoprotein
dc.subjectHolstein
dc.subjectPoint Mutation
dc.subjectPCR-RFLP
dc.subjectSLC35A3
dc.subjectAnemi
dc.subject?2 Integrin Glikoprotein
dc.subjectHolştayn
dc.subjectNokta Mutasyonu
dc.subjectPCR-RFLP
dc.subjectSLC35A3
dc.titleDetection of allele and genotype frequencies of bovine leukocyte adhesion deficiency, factor XI deficiency and complex vertebral malformation disease genes in holstein cattle
dc.title.alternativeHolştayn ırkı sığırlarda sığır lökosit bağlanma yetmezliği, faktör XI eksikliği ve kompleks vertebral malformasyon hastalıkları genlerinin allel ve genotip sıklıklarının tespit edilmesi
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Cakmak, Nezıha Hacıhasanoglu.pdf
Boyut:
241.82 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu