Deneysel çalışmalarda çevresel değişikliğe maruz kalan Fasciola Hepatica'nın salgıladığı protein miktarlarının bir ileri proteomik yaklaşımla incelenmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-8814-7351
dc.contributor.authorHaçarız, Orçun
dc.contributor.authorBaykal, Ahmet Tarık
dc.date.accessioned08.07.201910:49:13
dc.date.accessioned2019-07-08T20:19:18Z
dc.date.available08.07.201910:49:13
dc.date.available2019-07-08T20:19:18Z
dc.date.issued2014
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractAmaç: Ana konakçıdan çıkarıldıktan sonra çevresel değişikliğe maruz kalan Fasciola hepatica'nın salgıladığı protein miktarlarını bir ileri proteomik yaklaşımla incelemek.Yöntemler: Son konakçıdan toplanan ergin F. hepatica parazitleri doğrudan fosfat tamponlu su (FTS, oda sıcaklığında) içerisine konuldu ve 37°C'de 2 saat bekletildi (Enstitü'ye 1 saat içerisinde getirildikten sonra). Daha sonra, FTS, bir revize F. hepatica protein veri bankası (Universal Protein Resource; UniProt) ve veri bağımsız edinim yöntemi ile ileri bir proteomik yöntem (yüksek başarımlı sıvı kromatografisine bağlı, elektriksel püskürtme ile iyonlaştırma ve dört kutup zaman bazlı ölçüm içeren kütle spektrometresi sistemi; nanoUPLC-ESI-QTOF-MS) kullanılarak incelendi.Bulgular: Parazitlerle bekletilme sonrası FTS'nin proteomik analizinde, cathepsin L protease 1, fatty acid binding protein 1 ve 2, thioredoxin peroxidase (TPx), ve kunitz type proteinase inhibitor tanımlandı. Fasciola hepatica TPx miktarı, bu çalışmada tanımlanan diğer proteinlerin miktarlarına göre yaklaşık olarak 2-6 kat daha fazla bulundu (p<0,01).Sonuç: Çevresel değişiklikten kaynaklanan parazit üzerindeki stres, TPx salınımının uyarılması ile ilişkili olabilir. İleri proteomik yaklaşımların uygulanması, parazit-konakçı etkileşiminin aydınlatılmasında ve parazite karşı etkili korunma yöntemlerinin geliştirilmesinde yararlı veriler sağlayabilir.
dc.description.abstractObjective: Investigation of the abundance of proteins secreted by Fasciola hepatica, which is exposed to environmental change after it is removed from the main host, with an advanced proteomic approach.Methods: Adult Fasciola hepatica parasites, obtained from the main host, were directly placed in phosphate-buffered saline (PBS, at room temperature) and incubated at 37&deg;C for 2 hours (after arrival at the Institute within 1 hour). After this, without applying extra procedures, such as washing the parasites, secreted parasite proteins in PBS were investigated using an advanced proteomic method [a mass spectrometry system with electrospray ionization and quadrupole time-of-flight source coupled to ultra performance liquid chromatography, nano UPLC-ESI-QTOF-MS] with a reviewed F. hepatica protein database (Universal Protein Resource; UniProt) and data-independent acquisition method.Results: With the proteomic analysis of the PBS, after incubation with the parasites, cathepsin L protease 1, fatty acid-binding protein 1 and 2, thioredoxin peroxidase (TPx), and kunitz-type proteinase inhibitor were identified. The abundance of Fasciola hepatica TPx was approximately 2-6 times higher than that of the other proteins identified in this study (p&lt;0.01).Conclusion: The stress on the parasite stem from environmental change could be associated with the stimulation of the secretion of TPx. The application of advanced proteomic approaches could provide useful data in the development of effective protective methods against the parasite.
dc.identifier.citationHaçarız, O. ve Baykal, A. T. (2014). Deneysel çalışmalarda çevresel değişikliğe maruz kalan fasciola hepatica'nın salgıladığı protein miktarlarının bir ileri proteomik yaklaşımla incelenmesi. Türkiye Parazitoloji Dergisi, 38(2), 106-110. https://dx.doi.org/10.5152/tpd.2014.3443
dc.identifier.endpage110
dc.identifier.issn1300-6320
dc.identifier.issue2
dc.identifier.scopusqualityQ3
dc.identifier.startpage106
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12511/678
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.5152/tpd.2014.3443
dc.identifier.volume38
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.indekslendigikaynakPubMed
dc.language.isotr
dc.publisherTürkiye Parazitoloji Derneği
dc.relation.ispartofTürkiye Parazitoloji Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectFasciola Hepatica
dc.subjectTpx
dc.subjectProteomik
dc.subjectÇevresel Değişiklik
dc.subjectStres
dc.subjectFasciola Hepatica
dc.subjectTpx
dc.subjectProteomics
dc.subjectEnvironmental Change
dc.subjectStress
dc.titleDeneysel çalışmalarda çevresel değişikliğe maruz kalan Fasciola Hepatica'nın salgıladığı protein miktarlarının bir ileri proteomik yaklaşımla incelenmesi
dc.title.alternativeInvestigation of the abundance of proteins secreted by Fasciola Hepatica, which is exposed to environmental change in experimental studies, with an advanced proteomic approach
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Baykal, Ahmet Tarık-2014.pdf
Boyut:
410.78 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
PubMed İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu