An early prediction and diagnosis of sepsis in intensive care units: An unsupervised machine learning model

dc.authorid0000-0001-8359-5713
dc.authorid0000-0001-8863-8348
dc.contributor.authorCanbolat, Zehra Nur
dc.contributor.authorSilahtaroğlu, Gökhan
dc.date.accessioned2021-04-16T11:33:01Z
dc.date.available2021-04-16T11:33:01Z
dc.date.issued2020
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, İşletme ve Yönetim Bilimleri Fakültesi, Yönetim Bilişim Sistemleri Bölümü
dc.description.abstractSepsis infection, which is one of the most important causes of death in intensive care units, is seen as a severe global health crisis. If an early diagnosis of sepsis infection cannot be made, and treatment is not started rapidly, septic shock may result in multiple organ failure and death is almost inevitable. Therefore, it is vital to establish an early diagnosis and start the treatment at once. This study aims to accomplish a new model of unsupervised machine learning using lactate and Ph laboratory test values, which are considered to be important parameters to diagnose sepsis infection. The data used in the study have been obtained from MIMIC-III international clinical database. Unsupervised machine learning has been performed via the Fuzzy-C algorithm along with validity indexes like Xie Beni on patients’ data diagnosed sepsis and non-sepsis. The machine-generated ten labels at the end of the training session considering-designed validity indexes. The labelled cluster representatives have been reduced to two dimensions by Principal Component Analysis method in order to monitor the learning in a two-dimensional space. The study contributes to the literature by conducting unsupervised learning through two parameters (Lactate and Ph) and leading to multi-parameter studies. In addition, the study reports that there are five types of sepsis patterns in terms of Lactate and PH laboratory tests.
dc.description.abstractYoğun bakım servislerinde yaşanan ölümlerin en önemli sebeplerinden biri olan sepsis enfeksiyonu ciddi bir küresel sağlık krizi olarak görülmektedir. Sepsis enfeksiyonunun erken teşhisi yapılamaz ve hızla tedaviye başlanmaz ise çoklu organ yetmezliğine ve ölüme neden olabilmektedir. Bu nedenle hızlı sepsis tanısı ve tedavisi hayati önem taşımaktadır. Bu çalışmada amaç, sepsis enfeksiyonunun gelişimini etkileyen önemli parametrelerden olan laktat ve Ph değerlerini kullanarak yeni bir denetimsiz makine öğrenmesi modeli gerçekleştirmektir. Çalışma kapsamında kullanılan veriler MIMIC-III klinik veri tabanından elde edilmiştir. Çalışma genelinde sepsis tanısı konmuş ve sepsis tanısı konmamış hastalar üzerinde Bulanık-C ortalamalar algoritması ile denetimsiz makine öğrenmesi gerçekleştirilmiştir. Makine sepsis olan ve olamayan hastaları beşi sepsis pozitif, beşi sepsis negatif olacak şekilde 10 ayrı etiketle işaretlemiştir. Etiketlenen küme temsilcileri öğrenmenin monitorize edilebilmesi için Temel Bileşenler Analizi yöntemiyle iki boyuta indirgenmiştir. Çalışma, iki parametre özelinde (laktat ve Ph) değerlendirilerek denetimsiz öğrenme gerçekleştirmiş olması ve çok parametreli çalışmalara öncülük etmesi açısından literatüre katkı sağlamaktadır. Ayrıca, çalışma Lactat ve Ph değerleri bakımından beş ayrı kümede hasta bulunduğunu rapor etmektedir.
dc.identifier.citationCanbolat, Z. N. ve Silahtaroğlu, G. (2020). An early prediction and diagnosis of sepsis in intensive care units: An unsupervised machine learning model. Mugla Journal of Science and Technology, 6(1), 32-40. https://doi.org/10.22531/muglajsci.643554
dc.identifier.doi10.22531/muglajsci.643554
dc.identifier.endpage40
dc.identifier.issn2149-3596
dc.identifier.issue1
dc.identifier.startpage32
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.22531/muglajsci.643554
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12511/6740
dc.identifier.volume6
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isoen
dc.publisherMugla University
dc.relation.ispartofMugla Journal of Science and Technologyen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectSeptic Infection
dc.subjectUnsupervised Learning
dc.subjectFuzzy-C Means Clustering
dc.subjectIntensive Care Unit
dc.subjectSepsis Enfeksiyonu
dc.subjectDenetimsiz Makine Öğrenmesi
dc.subjectBulanık C-Ortalamalar
dc.subjectYoğun Bakım Ünitesi
dc.titleAn early prediction and diagnosis of sepsis in intensive care units: An unsupervised machine learning model
dc.title.alternativeYoğun bakım hastalarında sepsis enfeksiyonu tahmini: Denetimsiz makine öğrenmesi modeli
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
Canbolat-Zehra-2020.pdf
Boyut:
1.63 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama: