Longitudinal 16S rRNA data derived from limb regenerative tissue samples of axolotl ambystoma mexicanum

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-1502-1600
dc.authorid0000-0003-0352-1947
dc.authorid0000-0002-2752-1223
dc.contributor.authorDemircan, Turan
dc.contributor.authorİlhan, Ayşe Elif
dc.contributor.authorOvezmyradov, Guvanch
dc.contributor.authorÖztürk, Gürkan
dc.contributor.authorYıldırım, Süleyman
dc.date.accessioned10.07.201910:49:13
dc.date.accessioned2019-07-10T19:49:34Z
dc.date.available10.07.201910:49:13
dc.date.available2019-07-10T19:49:34Z
dc.date.issued2019
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Uluslararası Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Uluslararası Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Biyoistatistik ve Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Uluslararası Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Fizyoloji Ana Bilim Dalı
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Uluslararası Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Rektörlük, Rejeneratif ve Restoratif Tıp Araştırmaları Merkezi (REMER)
dc.descriptionWOS: 000469960800002
dc.descriptionPubMed ID: 31123261
dc.description.abstractThe Mexican axolotl (Ambystoma mexicanum) is a critically endangered species and a fruitful amphibian model for regenerative biology. Despite growing body of research on the cellular and molecular biology of axolotl limb regeneration, microbiological aspects of this process remain poorly understood. Here, we describe bacterial 16S rRNA amplicon dataset derived from axolotl limb tissue samples in the course of limb regeneration. The raw data was obtained by sequencing V3-V4 region of 16S rRNA gene and comprised 14,569,756 paired-end raw reads generated from 21 samples. Initial data analysis using DADA2 pipeline resulted in amplicon sequence variant (ASV) table containing a total of ca. 5.9 million chimera-removed, high-quality reads and a median of 296,971 reads per sample. The data constitute a useful resource for the research on the microbiological aspects of axolotl limb regeneration and will also broadly facilitate comparative studies in the developmental and conservation biology of this critically endangered species.
dc.identifier.citationDemircan, T., İlhan, A. E., Ovezmyradov, G., Öztürk, G. ve Yıldırım, S. (2019). Longitudinal 16S rRNA data derived from limb regenerative tissue samples of axolotl ambystoma mexicanum. Scientific Data, 6. https://dx.doi.org/10.1038/s41597-019-0077-7
dc.identifier.doi10.1038/s41597-019-0077-7
dc.identifier.issn2052-4463
dc.identifier.scopusqualityQ1
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.1038/s41597-019-0077-7
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12511/1649
dc.identifier.volume6
dc.identifier.wosqualityQ1
dc.indekslendigikaynakWeb of Science
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.indekslendigikaynakPubMed
dc.language.isoen
dc.publisherNature Publishing Group
dc.relation.ispartofScientific Dataen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsAttribution 4.0 International*
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/*
dc.subject16S rRNA
dc.subjectLimb
dc.subjectAxolotl
dc.titleLongitudinal 16S rRNA data derived from limb regenerative tissue samples of axolotl ambystoma mexicanum
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
demircan, t..pdf
Boyut:
1.67 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Makale Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
PubMed İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu