Genetic polymorphisms in 15 STR loci in the Turkish population living in İstanbul province

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-7129-5024
dc.contributor.authorÖzdilli, Kürşat
dc.contributor.authorDuvarcı Öğret, Yeliz
dc.contributor.authorOğuz, Rüştü
dc.contributor.authorİşsever, Halim
dc.contributor.authorYokeş, Mehmet Baki
dc.contributor.authorŞentürk Çiftci, Hayriye
dc.contributor.authorAbatay Sel, Figen
dc.contributor.authorKıvanç, Demet
dc.contributor.authorKekik Çınar, Çiğdem
dc.contributor.authorPehlivan, Sacide
dc.contributor.authorSavran Oğuz, Fatma
dc.date.accessioned2022-05-27T08:45:55Z
dc.date.available2022-05-27T08:45:55Z
dc.date.issued2022
dc.departmentİstanbul Medipol Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
dc.description.abstractObjective: Short tandem repeats (STRs) are short sequences of nucleotides that are repeated and distributed all over the genome. These polymorphisms enable investigation of the forensic, ancestral lineage and evolutionary studies in human population. Owing to the historical migration and ethnic groups, it is very valuable to evaluate genetic distances in Turkey. The aim of the present study is to examine the STR data of Istanbul and compare the genetic distances and allele frequency with the previously published data of 27 countries from Europe, Asia, America, Africa and Middle East. Material and Method: Peripheral blood samples were obtained from 400 healthy individuals. DNA samples were amplified using a commercial kit. Multiplex STR-PCR (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) was used and the amplicons were evaluated on an ABI 3130 Genetic Analyzer. Results: Among all loci, D21S11 and D18S51 were the most polymorphic loci. The power of discrimination (PD) ranged from 0.8329 (TPOX) to 0.9722 (D18S51). The combined PD and probability of exclusion (PE) were found to be >0.99999999 and 0.99999671, respectively. Conclusion: In this study, six STR markers were selected to compare the genetic distances and allele frequency of the present results with the results of twenty-seven studies which were published previously. This study indicates that the population in Turkey is an intermediate between Europe, Middle East and Central Asia.
dc.description.abstractAmaç: Kısa ardışık tekrarlar (STR), tekrarlanan ve genomun her yerine dağılan kısa nükleotid dizileridir. Bu polimorfizmler, insan popülasyonunda adli tıp, ata soyları ve evrim çalışmalarının araştırılmasını sağlar. Tarihsel göç ve etnik gruplar nedeniyle Türkiye'deki genetik mesafelerin değerlendirilmesi çok değerlidir. Bu çalışmanın amacı, İstanbul'un STR verilerini incelemek ve aynı zamanda, Avrupa, Asya, Amerika, Afrika ve Orta Doğu'dan 27 ülkenin daha önce yayınlanmış verilerini kullanarak genetik mesafeleri ve alel frekansını karşılaştırmaktır. Materyal ve Metot: Dörtyüz sağlıklı kişiden periferik kan örnekleri toplandı. DNA örnekleri ticari bir kit kullanılarak çoğaltıldı. Multiplex STR-PCR (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) yöntemi kullanıldı ve amplikonlar ABI 3130 Genetic Analyzer’da değerlendirildi. Bulgular: D21S11 ve D18S51 lokusları hepsinin içinde en polimorfik lokuslardı. Ayrımcılık gücü 0,8329 (TPOX) ile 0,9722 (D18S51) arasındaydı. Birleşik ayrımcılık gücü ve dışlama olasılığı sırasıyla >0,99999999 ve 0,99999671 idi. Sonuç: Bu çalışmada, mevcut sonuçların genetik mesafeleri ve allel frekansı açısından altı STR belirteci seçildi ve daha önce yayınlanmış yirmi yedi çalışmanın verileri ile karşılaştırıldı. Sonuçlar Türkiye'deki nüfusun Avrupa, Orta Doğu ve Orta Asya arasında bir ara bölge olduğunu göstermektedir.
dc.identifier.citationÖzdilli, K., Duvarcı Öğret, Y., Oğuz, R., İşsever, H., Yokeş, M. B., Şentürk Çiftci, H. ... Savran Oğuz, F. (2022). Genetic polymorphisms in 15 STR loci in the Turkish population living in İstanbul province. Nobel Medicus, 18(1), 54-61.
dc.identifier.endpage61
dc.identifier.issn1305-2381
dc.identifier.issue1
dc.identifier.scopus2-s2.0-85130045366
dc.identifier.scopusqualityQ4
dc.identifier.startpage54
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12511/9472
dc.identifier.volume18
dc.identifier.wos000798416700006en_US
dc.identifier.wosqualityN/A
dc.indekslendigikaynakWeb of Science
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.institutionauthorÖzdilli, Kürşat
dc.language.isoen
dc.publisherNobelmedicus
dc.relation.ispartofNobel Medicusen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.subjectHuman Genetics
dc.subjectPolymorphism
dc.subjectPopulation Genetics
dc.subjectShort Tandem Repeat
dc.subjectİnsan Genetiği
dc.subjectPolimorfizm
dc.subjectPopülasyon Genetiği
dc.subjectKısa Tandem Tekrar
dc.titleGenetic polymorphisms in 15 STR loci in the Turkish population living in İstanbul province
dc.title.alternativeİstanbul’da yaşayan Türk nüfusunda 15 STR lokusunda genetik polimorfizmler
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
Ozdilli-Kursat-2022.pdf
Boyut:
267.45 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Makale Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu