Yazar "Kalkan, Rabia" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Evidence that melatonin downregulates Nedd4-1 E3 ligase and its role in cellular survival
    (Academic Press Inc Elsevier Science, 2019) Yalçın, Esra; Beker, Mustafa Çağlar; Türkseven, Şeyma; Çağlayan, Berrak; Gürel, Büşra; Kılıç, Ülkan; Çağlayan, Ahmet Burak; Kalkan, Rabia; Baykal, Ahmet Tarık; Keleştemur, Taha; Kılıç, Ertuğrul
    Indolamine melatonin structurally resembles non-covalent proteasome inhibitors; however, the role of ubiquitin proteasome system (UPS) in neuronal survival and how melatonin carries out UPS inhibition remain largely unknown. With the use of melatonin treated cells, we evaluated the expression of Nedd4-1, an E3 ligase, how melatonin regulates its activity and its relationship with neuronal survival. Nedd4-1 was upregulated in the hypoxic condition in both control and Nedd4-1 overexpressed cells and melatonin treatment reversed its expression in both normoxic and hypoxic conditions, which was associated with increased cellular survival. Melatonin had no effect on the expression of Nedd4-1 at mRNA level. However, when melatonin was administered along with protein synthesis inhibitor cycloheximide, protein level of Nedd4-1 was further reduced, indicating that melatonin possibly downregulates Nedd4-1 after its synthesis. Notably, co-immunoprecipitation analyses followed by Liquid chromatography Mass Spectrometry (LC-MS/MS) revealed that melatonin may dissociate ribosomal proteins, such as RS19, RL23A, and nucleophosmin from Nedd4-1, while 40S ribosomal protein S7 and 60S ribosomal protein L35 came into contact with Nedd4-1 upon melatonin treatment. By using IPA analyses, we obtained further data indicated novel target molecules of melatonin in hypoxic conditions, including OTOF, SF3B2, IPO5, ST13, FGFR3, Mxl/Mx2, playing roles in RNA splicing and trafficking, growth factor and interferon signaling. Here, we described a new insight into the role of melatonin in UPS functioning by proposing a molecular mechanism through which melatonin regulates Nedd4-1.
  • Küçük Resim
    Öğe
    İn vitro amiloid-beta toksisite modeli kullanılarak sırt1 protein inhibisyonunun eksozomal protein içeriğine etkilerinin araştırılması
    (İstanbul Medipol Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2018) Kalkan, Rabia; Kılıç, Ülkan; Kılıç, Ertuğrul
    Alzheimer hastalığı (AH), dünya genelinde yaklaşık 50 milyon insanı etkileyen, ölümcül, nörodejeneratif bir hastalıktır. Patofizyolojisinin temelinde hücre dışı senil amiloid-beta plakları ve hücre içi nörofibriler yumaklar bulunmaktadır. Hastalığın seyrini durdurabilecek ya da yavaşlatabilecek bir tedavi henüz bulunmamaktadır. SIRT1 birçok kritik hücresel süreçte görev alan bir histon deasetilaz enzimidir. AH modellerinde inhibisyonunun kognitif fonksiyonlarda ve hafızada iyileşmeyi sağladığı gösterilmiştir. Eksozomlar nano boyutta, hücre-hücre iletişiminde görevli, tüm vücut sıvılarında bulunan, endozomal kökenli veziküllerdir. AH'de amiloid beta ve tau taşıdıkları gösterilmiştir. Bu çalışmada in-vitro amiloid beta toksisitesi uygulanan SH-SY5Y hücrelerinde, SIRT1 enzim inhibitörünün (Ex527), PI3K/AKT yolağındaki proteinlere ve hücrelerden salınan eksozom miktarına etkisi araştırılmıştır. Toksisite uygulamasından önce ve sonra hücrelere verilen Ex527'nin p-GSK3-? ve p-GSK3-?'nin ekspresyon seviyelerini arttırdığı, p-mTOR'un ekspresyonunu azalttığı bulunmuştur. Amiloid beta verilen gruba kıyasla toksisite uygulamasından önce hücrelere verilen Ex527'nin hücrelerden salınan eksozomları arttırdığı bulunmuştur.