Yazar "Kalender, Semiha Mervenur" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim
    Öğe
    Benzotriazole-oxadiazole hybrid compounds: Synthesis, anticancer activity, molecular docking and ADME profiling studies
    (Elsevier B.V., 2022) Mermer, Arif; Bülbül, Muhammet Volkan; Kalender, Semiha Mervenur; Keskin, İlknur; Tüzün, Burak; Eyüpoğlu, Ozan Emre
    Herein the designed novel benzotriazole-oxadiazole hybrid compounds were synthesized using both conventional method and ultrasound sonication (US) as an environmentally friendly method. It was observed that the US method provided an increase in reaction yields by reducing the reaction time approximately 3-fold. The synthesized compounds were investigated against PANC-1 cell line. All obtained compounds were characterized by FT-IR, 1H NMR, 13C NMR and MS spectroscopic techniques. The compounds 4b and 4d exhibited very promising anticancer activity results with IC50 values of 117.5 ± 0.084 ?M and 87.82 ± 4.319 ?M, respectively. Further, molecular docking studies to suggest how the synthesized compounds interact with the kinase domain of human DDR1 in complex of pancreatic Cancer proteins (PDB ID: 6HP9), and the crystal structure of PDEd of pancreatic Cancer proteins (PDB ID: 5E80). It was concluded from the docking studies that the compound 4d demonstrated the highest binding score values for active site of both proteins. Afterwards, ADME calculations were performed to examine the drug properties of benzotriazole-oxadiazole hybrid compounds.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Ishikawa ve huvec hücreleri ile oluşturulmuş sferoid mono-kültür ve sferoid ko-kültür modellerinin morfolojik ve immünohistokimyasal (E-kaderin ve beta-katenin) olarak karşılaştırılması
    (İstanbul Medipol Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2020) Kalender, Semiha Mervenur; Keskin, İlknur
    Günümüzde giderek artan kanıtlar, üç boyutlu hücre kültürü modellerinin, iki boyutlu hücre kültürü modellerine göre in vivo tümör mikro ortamını daha iyi yansıttığını göstermektedir. Ko-kültür modelleri, hücreler ve in vivo mikro ortam arasındaki iletişimi daha iyi anlamak için ideal hücre kültürü modelleridir. E-kaderin ekspresyon seviyelerindeki değişiklikler, kanser metastazı ve ilerlemesi ile yakından ilişkilidir. ?-katenin, E-kaderinin hücre yapışmasına aracılık eder. Endotel hücreler, tümör mikro ortamındaki stromal hücre bileşenleridir. Endotel hücrelerinde E-kaderin ekspresyonunun çok az olduğu veya hiç olmadığı bilinmektedir. Çalışmamızda, hücre etkileşimlerini daha iyi yansıtmak için Huvec ve Ishikawa hücreleri (endometriyal kanser hücre hattı) kullanılarak hem iki boyutlu hem de üç boyutlu mono-kültür ve ko-kültür modelleri oluşturulmuştur. Üç boyutlu hücre kültürü modelinde sferoidler üç gün boyunca takip edildi. Ko-kültür sferoidlerinin boyutu, mono-kültür sferoidlerinden önemli ölçüde daha büyük kaydedildi. E-kaderin ve ?-katenin ekspresyon seviyeleri, immünofloresan boyama ile ölçüldü. İki ve üç boyutlu modellerde, Ishikawa hücrelerinin mono-kültüründe E-kaderin ekspresyon seviyeleri, Huvec ve ko-kültür hücrelerinden önemli ölçüde daha yüksek kaydedildi. Benzer şekilde, ?-katenin ekspresyon seviyeleri iki boyutlu modellerde Ishikawa hücrelerinin mono-kültüründe daha yüksek iken, üç boyutlu modellerde ?-katenin ekspresyon seviyelerinde önemli bir farklılık gözlenmedi. E-kaderin ekspresyon seviyelerinin, Huvec ve Ishikawa hücrelerinin hem iki hem de üç boyutlu ko-kültürlerinde önemli ölçüde azaldığı kaydedildi. Bu sonuçlar, endotel hücrelerinin Ishikawa hücrelerinde E-kaderin ekspresyonunu baskılayarak endometriyal kanser ilerlemesinde değişikliklere neden olabileceği fikrini desteklemektedir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Mtor pathway inhibition, anticancer activity and in silico calculations of novel hydrazone derivatives in two- and three-dimensional cultured type 1 endometrial cancer cells
    (2024) Bülbül, Muhammet Volkan; Mermer, Arif; Kolbaşı, Bircan; Kocabaş, Fatih; Kalender, Semiha Mervenur; Kireçtepe Aydın, Kıymet Aslı; Keskin, İlknur
    Background: Endometrial cancer remains a significant health concern, with type 1 endometrial cancer characterized by aberrant expression of estrogen-dependent and mTOR pathway proteins. In this study, we evaluated the effects of two novel hydrazone derivatives against the Ishikawa cell line, a model for endometrial cancer. Methods: Two novel hydrazone derivatives, MVB1 and MVB2, were synthesized and characterized. The anticancer activity of the compounds in both two- and three-dimensional cultured Ishikawa cells was evaluated by MTT assay. The interaction of the compounds with proteins in the PI3K/AKT/mTOR pathway was evaluated by molecular docking studies and in vitro western blot analyses were performed. Additionally, ADME/T calculations were performed to evaluate the drug-like properties of the compounds. Results: MVB1 and MVB2 showed promising anticancer activity with IC50 values of 8.3 ± 0.5 µM and 9.0 ± 1.2 µM in 2D cultures, respectively, and 49.9 ± 2 µM and 20.6 ± 1.9 µM in 3D cultures, respectively. Molecular docking studies revealed significant interactions between these compounds and key proteins in the PI3K/AKT/mTOR pathway, with MVB1 exhibiting the highest mean binding score (−10.5 kcal/mol) among PI3K, AKT1, and mTOR proteins. In vitro studies confirmed that MVB1 effectively suppressed PI3K protein expression in both 2D and 3D cultures (p ≤ 0.0001). Conclusions: The findings suggest that MVB1 and MVB2, especially MVB1, are promising candidates for further development as potential therapeutics for endometrial cancer by targeting the PI3K/AKT/mTOR pathway.